序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
八十一难经
第1部分第2部分
自序卷一祷告药皇誓疏温证论治人身一小天地论书方宜人共识说卷二日讲杂记《金匮》上工治未病一节辩辨《金匮》之二阳之病发心脾解维脉为病论治张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论医宜博览论读《伤寒补
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
序自序凡例卷之一调经门论经主冲任二脉论心脾为经血主统论脾胃生血论经不调由风邪客于胞中论三月一来为居经论师尼寡妇异乎妻外家之治论调经当抑气论调经先去病论调经大法论经水异色论经候愆期论月水多少论月水不利论
述古斋医书叙叙二叙三叙四叙五凡例卷一·辨证觇神气审形色诊面察眼察耳察唇口察齿察鼻准验舌苔诊指纹察手足听声按胸腹询溲便候脉卷二·立法按法摩法掐法揉法推法运法搓法摇法汗法吐法下法针法灸法法砭法浴法法疏表法
氨基酸及其代谢产物血清（血浆）尿酸（UA）血清苯丙氨酸血清酪氨酸（Tyr）血液非蛋白氮（NPN）血液还原型谷胱甘肽（GSH）血液肌酸（Cre）血液肌酐（Cr）血液尿素氮（BUN）垂体激素检测5－羟色胺
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
自序原病篇卷一·上焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温伏暑湿温、寒湿温疟秋燥补秋燥胜气论卷二·中焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑寒湿湿温秋燥卷三·下焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑