神农尝百草论亢则害承乃制论四气所伤论张仲景伤寒立法考伤寒温病热病说伤寒三阴病或寒或热辨阳虚阴盛阳盛阴虚论伤寒三百九十七法辨伤寒四逆厥辨呕吐干呕哕咳逆辨中风辨中暑中热辨积热沉寒论泻南方补北方论五郁论二阳
八十一难经
萧序范序朱序何序卷一医工论禀受论初生论回气论洗浴论断脐论相视寿夭论初生服药论中寒论初生不乳论脐风撮口论胎中病论诸不治病卷二五气论心肝脾肺肾乳母论慎护论食忌论大小论诸般色泽纹证论诸色泽候诸处纹状候五脏主
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
凡例上卷小儿初受气论受胎论小儿形证歌颅囟要略择乳母论慎护论护持歌调理五法长寿无病歌寿夭歌杂病证候歌一见生死歌恶症十五候通真子诊脉歌诊脉歌诊脉快捷方式歌五经统论变蒸赋变蒸日例看三关证经诀入门辩症歌相手指
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八
石药尔雅
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方