原序自序卷一脉论辨五脏六腑部位脉法辨人迎三部趺阳九候五脏六腑脉法诊诸病证脉法辨脉形及变化所主病证法卷二寒证热证风食风湿疟疾痹证劳伤气病血证卷三诸积诸痛眩晕厥证痰饮消证疸病卷四咳嗽喘证呕吐小便妇人科
针灸节要
简介奇效良方内容细目卷之一 风门（附论）（一）卷之二 风门（附论）（二）卷之三 风门（附论）（三）卷之四 寒门（附论）卷之五 暑门（附论）卷之六 湿门（附论）卷之七 燥门（附论）卷之八 火门（附论）卷
内容玉石类丹砂云母玉泉钟乳矾石硝石朴硝石石胆空青太一禹余粮白石英紫石英五石脂赤符黄符白符黑符白青扁青雄黄硫黄水银磁石凝水石阳起石孔公孽理石长石白矾石戎盐卤咸白垩石流赤草木类菖蒲菊华人参术菟丝实牛膝委萎
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
眼科奇书
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序上卷本症治法兼症治法变症治法疠疡类症本症治验类症治验中卷续治诸症下卷各症方药
第1部分第2部分第3部分第4部分
序自序自序杂症大小合参凡例（小引）杂症大小合参凡例痘疹全集凡例杂症痘疹药性主治合参凡例杂症大小合参卷首上 内经纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论