原序自序卷一脉论辨五脏六腑部位脉法辨人迎三部趺阳九候五脏六腑脉法诊诸病证脉法辨脉形及变化所主病证法卷二寒证热证风食风湿疟疾痹证劳伤气病血证卷三诸积诸痛眩晕厥证痰饮消证疸病卷四咳嗽喘证呕吐小便妇人科
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
仁斋直指方论
医家秘奥之脉法解
自序卷一祷告药皇誓疏温证论治人身一小天地论书方宜人共识说卷二日讲杂记《金匮》上工治未病一节辩辨《金匮》之二阳之病发心脾解维脉为病论治张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论医宜博览论读《伤寒补
序针经标幽赋流注通玄指要赋针经直说络说交经辨气血问答手足三阴三阳表里支干配合流注八穴序定八穴所在真言补泻手法夫妇配合古法流注杂忌法针灸避忌太一之图序冬至叶蛰宫说附∶针灸杂说窦汉卿流注指要后序
药性歌括四百味
谢氏《发背对口治诀论》序总论附∶谢氏外科秘法附∶对口方附∶杨州存济堂药局膏药方
序内消法一艾灸法二神火照法三刀针砭石法四围药法五开口除脓法六收口法七总论服药法八详论五善七恶救援法九将息法十外科症治方药发背脑疽鬓疽井口疽疔疮喉痹缠喉风缠舌喉风乳蛾舌衄悬痈（一）腮痈喉疮走马牙疳喉瘤茧
脚气治法总要