卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
养生随笔
简介医方集宜内容细目叙凡例八款六气十二经见证卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
序自序小儿要略论看小儿病状歌虎口三关古人辨色看危症法小儿正面初生门脐风门惊风门胎热门发热门感冒门伤风门伤寒门伤暑门伤食门咳嗽门喘急门咳血门呕吐门霍乱门吐泻门泄泻门痢疾门腹痛门疟疾门疳积门痫症门烦渴门腹
序自序凡例卷之一调经门论经主冲任二脉论心脾为经血主统论脾胃生血论经不调由风邪客于胞中论三月一来为居经论师尼寡妇异乎妻外家之治论调经当抑气论调经先去病论调经大法论经水异色论经候愆期论月水多少论月水不利论
序卷一治喉秘法治喉要诀临症二十法焦氏喉症图形针药秘传单方治喉痹单方卷二应用良方焦氏喉科煎药方诸穴灸刺各法附方
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并